IA modifica genes microbianos para produzir combustíveis renováveis

Há mais de meia década, o Centro de Inovação em Bioenergia (CBI) vem mexendo com genes de plantas e microbianos para enfrentar o desafio final de uma economia sustentável de base biológica.

O CBI usa supercomputadores, algoritmos de aprendizagem profunda e ferramentas de edição de genes, como o CRISPR Cas9, para vincular o genótipo ao fenótipo. No entanto, sua pesquisa tem sido prejudicada pela incompatibilidade dos modelos de emenda de genes existentes com os genomas microbianos.

Para aprimorar o projeto do maquinário CRISPR Cas9, cientistas da Biblioteca Nacional de Oak Ridge (ORNL) criaram um modelo de IA explicável e o treinaram para identificar as pistas moleculares que permitem o direcionamento de regiões específicas de um genoma microbiano. O novo modelo, chamado de floresta aleatória iterativa https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkad736/7279034já foi demonstrado que otimiza a clivagem e a ligação do DNA na bactéria E. Coli.